Chaos, 25(12), 123117p. (2015) DOI:10.1063/1.4938186

Edit distance for marked point processes revisited: An implementation by binary integer programming

Y. Hirata, K. Aihara

We implement the edit distance for marked point processes [Suzuki et al., Int. J. BifurcationChaos20, 3699-3708 (2010)] as a binary integer program. Compared with the previous implementation using minimum cost perfect matching, the proposed implementation has two advantages: first, by using the proposed implementation, we can apply a wide variety of software and hardware, even spin glasses and coherent ising machines, to calculate the edit distance for marked point processes; second, the proposed implementation runs faster than the previous implementation when the difference between the numbers of events in two time windows for a marked point process is large.

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