Chemical Reviews, 102(5), 1471–1492p. (2002) DOI:10.1021/cr0101499

Nonlinear Signal Analysis Methods in the Elucidation of Protein Sequence-Structure Relationships

A. Giuliani, R. Benigni, J. P. Zbilut, C. L. Webber, Jr., P. Sirabella, A. Colosimo

The relationship between sequence-embedded information and folding behavior of proteins is currently a dominant concern of both theoretical and applied biochemical research. More specifically, this concern redounds to areas such as (a) sequence-based functional predictions, (b) 3D structure-based functional predictions, and (c) folding mechanism elucidation. The above issues are regarded as key points in basic research, and all of them have immediate applicable spin-offs in biotechnology, where the elucidation of new protein structures is of main interest for areas ranging from pharmaceutical industry to electronics. Moreover, the completion of the sequencing phase of the human genome project shifted the attention of the scientific community to so-called "structural genomics" where the structural consequences of genome data in terms of protein structure and activity are exploited. This new phase, called "post-genomic", in contrast with the previous one is of direct interest to chemists. ...

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